R-4.0.1-Rcmdr套件開啟異常

問題: 近日有網友提及使用 R-4.0.1 時, 載入 Rcmdr套件異常, 無法正常載入.

方法: 考慮 Windows 環境, 一般遇到套件無法載入, 可參考以下方法:

1. 在 R的原生環境下重新安裝套件
2. 使用檔案總管, 刪除套件所在資料夾, 再重新安裝.
3. 安裝較低版本的套件
4. 安裝較低版本的R

本例採用方法4, 重新安裝較低版本的R, 即改用 R-4.0.0  即可正常開啟 Rcmdr視窗.

下載並安裝 R-4.0.0 https://cran.csie.ntu.edu.tw/bin/windows/base/old/

參考完整說明:

https://github.com/rwepa/DataDemo/blob/master/R-4.0.1-Rcmdr-correct.pdf

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R軟體教學影片

R軟體教學影片

參考R教學-基礎篇影片說明

http://web.ydu.edu.tw/~alan9956//R/R_20110704/R_demo.htm

注意: 限育達校內IP, 整理中...
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Data mining with Rattle – ROC curve (SVM and NN)

# 範例說明 R圖形化使用者介面 rattle 套件 執行 ROC curve 比較

步驟 1

安裝並執行 rattle 套件－資料探勘使用者介面

install.packages(“rattle”)

library(rattle)

rattle()

步驟 2

匯入kernlab套件的資料集spam, 一般採用 spam {kernlab} 表示, 步驟如下:

Data \ Source: 選取 Library \ Data Name: 選取 「spam:kernlab:Spam E-mail Database」 \ 按 執行.

匯入 spam 資料結果, 此為垃圾郵件資料集, 其中第58個變數是目標變數且為類別型資料, 在R中屬於因子(factor)資料物件, 在最下列訊息區顯示全部有 4601筆觀測值, 58個輸入變數, 可使用分類模型.

步驟 3

Rattle 的Support Vector Machines 方法, 採用 kernlab 套件的ksvm方法, 在 R console 視窗中輸入以下指令可查詢其使用說明.

library(kernlab)

?ksvm

Model \ Type 選取 SVM \ Kernel 採用預設值 Radial Basis (rbfdot) \ 按 執行.

步驟 4

使用 Neural Network 方法, Rattle 採用 nnet 套件的nnet 方法, 該方法採用Feed-forward neural networks 且為一個隱藏層 (hidden layer), 預設節點數是十個.

Model \ Type 選取 Neural Net \ 按 執行.

步驟 5

模式比較主要採用 ROC curve 方法.

參考:
ROC簡介 https://github.com/rwepa/DataDemo/blob/master/roc_introduction.pdf
ROCR套件說明 https://github.com/rwepa/DataDemo/blob/master/roc_r_example.pdf

Rattle 會針對之前已完成的模型進行效益評估.

Evaluate \ Type: 選取 ROC \ Model: SVM , Neural Net 打勾 \ 按 執行.

步驟 6

考慮實際結果有二種情形(Yes, No), 在 ROC curve視窗中x軸表示 False Positive (FP) rate (實際為N, 但預模型分類為Y, 此時FP愈小愈好), y軸表示 TP rate (實際為Y, 且預模型分類為Y, 此時FP愈大愈好), 因此, ROC曲線愈偏向左上角愈好,即曲線以下面積較大者較佳. 由圖形可知 ksvm 較偏向於左上角位置, 因此採用 svm 較佳。

下載說明: r-rattle-ROCcurve.pdf

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R 圖形化使用者介面 : JGR + Deducer

# title: JGR, Duducer 安裝
# updated: 2013.8.27
JGR 是一種以 Java 為基礎的 R 圖形化使用者介面, JGR 表示 Java Gui for R.
三個安裝步驟(for Windows):

步驟1:
安裝 Java JRE 或 Java JDK
http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html

步驟2:
安裝  JGR, Deducer, DeducerExtra 套件
install.packages(c("JGR", "Deducer", "DeducerExtra"))

步驟3:
case 1. 執行
library(JGR)
JGR()
如果 JGR 視窗有正常開啟, 此時不用下載  JGR執行檔.

case 2. 如果有錯誤, 請嘗試下載 JGR執行檔
Windows 7 -64bit 下載

Windows XP - 32bit 下載

開啟 JGR 執行畫面如下:

註：開啟後可設定載入與顯示套件:

1. 選取 Packages & Data \ Package Manager \ 將 Deducer(如果已打勾, 則不用更改), DuducerExtras 等四個選項打勾, 按  Refresh . 

2. 更新完畢之 Deducer 功能選項, 已增加 Extras 功能.

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Rcmdr package - 圖形化使用介面

採用圖形介面的統計軟體套件 - R Commander - Rcmdr package。

 

檔案：R03_RCommander.pdf

頁數：50
下載：https://github.com/rwepa/DataDemo/blob/master/R03_RCommander.pdf

十萬筆測試資料,參考投影片 (R03_RCommander.pdf) 第29頁 。
檔案：R03_Orders.txt

下載: https://github.com/rwepa/DataDemo/blob/master/R03_Orders.txt

迴歸分析測試資料,參考投影片 (R03_RCommander.pdf) 第44頁 。
檔案：R03_Maintain.txt

下載: https://github.com/rwepa/DataDemo/blob/master/R03_Maintain.txt

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