VirtualBox + Ubuntu + R + RStudio

 RWEPA | VirtualBox + Ubuntu + R + RStudio 簡介

🌸YouTube  (包括中文字幕)：https://youtu.be/DxZUj9quKEI

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VirtualBox + Ubuntu + R + RStudio 執行畫面:

Outline:

1.VirtualBox 下載與安裝

2.Ubuntu下載與安裝

3.Ubuntu + R 安裝

4.Ubuntu + RStudio 安裝

5.結論

🌸PDF: 

• https://github.com/rwepa/ubuntu_r_rstudio/blob/main/virtualbox_ubuntu_r_rstudio.pdf
  

🌸安裝指令: 

• https://github.com/rwepa/ubuntu_r_rstudio/blob/main/virtualbox_ubuntu_r_rstudio.txt

# virtualbox

# ubuntu

# R

# rstudio

R自訂套件安裝目錄 (customized package directory)

主題

R 在安裝目錄時, 如果有客製化需求, 可以設定套件安裝目錄, 本篇說明R的安裝目錄, 套件訊息與客製化安裝套件目錄之方法. 本方法使用R函數設定, 可用於 Windows, macOS, ubuntu等作業系統, 以下執行結果可能因使用者名稱與安裝路徑不同而有所差異.

感謝 Ying-Zhe 提供此問題.

關鍵字

# R.home()

# find.package('套件名稱')

# packageVersion('套件名稱')

# .libPaths()

# Rprofile.site

1. 查詢R的安裝目錄

R.home()

# Windows 10

# "C:/PROGRA~1/R/R-41~1.2"

# macOS Catalina

[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Resources"

# ununtu 20.04.3

[1] "/usr/lib/R"

2. 套件安裝目錄

find.package('ggplot2')

# Windows 10

[1] "C:/Users/user/Documents/R/win-library/4.1/ggplot2"

# macOS Catalina

[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.1/Resources/library/ggplot2"

# ununtu 20.04.3

[1] "/home/rwepa/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/ggplot2"

3. 套件版本

packageVersion('ggplot2')

[1] ‘3.3.5’

4. 套件訊息

packageDescription('ggplot2')

Package: ggplot2

Version: 3.3.5

Title: Create Elegant Data Visualisations Using the Grammar of Graphics

....

5. 自訂套件安裝目錄

方法1-每次啟動R或RStudio皆須設定

# 步驟1 顯示套件下載與安裝目錄

.libPaths()

# [1] "C:/Users/user/Documents/R/win-library/4.1"

# [2] "C:/Program Files/R/R-4.1.2/library"

# 步驟2 建立自訂套件安裝目錄

# 考慮在使用者目錄中,以檔案總管建立 mypackages 目錄,本步驟依實際需求修改.

# 自訂套件目錄之完整路徑 C:/Users/user/mypackages

# 步驟3 加入自訂套件目錄於系統套件搜尋路徑之中

.libPaths('C:/Users/user/mypackages')

# 步驟4 顯示目前套件下載與安裝目錄

.libPaths()

# 結果顯示已經加入完成

# [1] "C:/Users/user/mypackages"          

# [2] "C:/Program Files/R/R-4.1.2/library"

# 步驟5 安裝套件

install.packages("e1071")

# 步驟6 測試套件之載入, 結果顯示正常載入套件,準備收工...

library(e1071)

# 結果正常載入,無錯誤訊息

# 步驟7 重新啟動 R或RStudio 測試套件之載入,發生錯誤!!!

library(e1071)

# Error in library(e1071) : there is no package called ‘e1071’

# 步驟8 重新加入系統套件搜尋路徑之中(因為每次啟動皆須設定)

.libPaths('C:/Users/user/mypackages')

.libPaths()

[1] "C:/Users/user/mypackages"          

[2] "C:/Program Files/R/R-4.1.2/library"

# 步驟9 測試套件之載入,結果顯示正常載入套件,正式完成,還有方法2 ...

library(e1071)

# 結果正常載入,無錯誤訊息

方法2-設定於R組態檔,每次啟動R/RStudio時無需設定

考慮 Windows 10 作業系統, R組態檔 Rprofile.site之位置如下

# C:\Program Files\R\R-4.1.2\etc\Rprofile.site

# 考量已經於以下目錄(C:\Users\user\Documents\R\win-library\4.1)安裝套件

# 使用 Notepad++ 等文字編輯器軟體,於檔案最底下加入以下1行程式,儲存檔案.

.libPaths(c('C:/Users/user/mypackages', 'C:/Users/user/Documents/R/win-library/4.1'))

# 下圖為 Notepad++ 免費軟體編輯 Rprofile.site 畫面

# 重新啟動R或RStudio,套件安裝會自動安裝於 C:/Users/user/mypackages 目錄.

# end

使用wubi軟體安裝 Ubuntu

# 本篇文章說明在Windows 環境中利用wubi免費軟體安裝 Ubuntu.


# step 1 下載 wubi


連結wubi 首頁, http://wubi-installer.org/

選取 [Get the installer]

選取 [Not now, take me to the download]

按 [儲存]

# step 2 安裝32位元 Ububtu

因執行環境為 Windows 7 - 64位元, 因此預設安裝64位元Ubuntu, 如果希望安裝 32位元Ubuntu, 則須執行此步驟, 否則直接採用step 3.

選取 wubi.exe, 按 右鍵 \ 建立捷徑

按 右鍵 \ 內容 \ 目標中最後輸入 「--32bit」, 按 確定.

雙按此捷徑即可安裝 32位元 Ubuntu.

# step 3 安裝64位元 Ububtu

選取 wubi.exe

Ubuntu安裝程式畫面中輸入 使用者名稱, 密碼.

安裝畫面.

安裝完成後選取 控制台 \ 程式和功能 會包括 Ubuntu 的程式, 如果將來不再使用, 按 [解除安裝變更] 即可移除 Ubuntu.

# step 4 使用 Ububtu

重新開機會有二個選項 Windows 7 與 Ubuntu, 選取第2個 Ubuntu 即可使用 Ubuntu.

Ubuntu 安裝統計軟體 R

RWEPA | Install R on Ubuntu

# Ubuntu 中文輸入法

# 2024.12.29

# 速成輸入法

sudo apt-get install ibus

sudo apt-get install ibus-table-quick 

# 注音輸入法

sudo apt-get install ibus-zhuyin

# 重新啟動

ibus restart

# Settings \ Language Support \ 選取 Chinese (simplified)

# Settings \Keyboard \ Input Sources \  選取 Chinese(QuickClassic) , Chinese(Zhuyin)

# Ubuntu 22.04.2 LTS 安裝 R-4.3.0

# 2023.6.23

步驟1. Set new Ubuntu repositories

sudo apt install -y --no-install-recommends software-properties-common dirmngr

步驟2. Add the keys

wget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc | sudo tee -a /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc

步驟3. add the R repo from CRAN

sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu $(lsb_release -cs)-cran40/"

步驟4. Install R 4.3.0

sudo apt install -y r-base r-base-core r-recommended r-base-dev

# 參考以下 R 完成畫面.

# Ubuntu 22.04.2 LTS 安裝 RStudio

# 2023.6.23

# 方法1

# 步驟1. 安裝基本模組

sudo apt install libclang-dev libpq5

# 步驟2. 安裝 RStudio

sudo snap install rstudio --classic

# 方法2

# 步驟1. 安裝基本模組

sudo apt install libclang-dev libpq5

# 步驟2. 下載 RStudio

https://posit.co/download/rstudio-desktop/

cd Downloads

wget https://download1.rstudio.org/electron/jammy/amd64/rstudio-2023.06.0-421-amd64.deb

# 步驟3. 安裝RStudio

sudo dpkg -i rstudio-2023.06.0-421-amd64.deb

# 參考以下 RStudio 完成畫面.

# CentOS 7 安裝R

# 2017.7.2 更新

sudo yum install epel-release

sudo yum install R

# CentOS 7 更新R:

sudo yum update R

# Ubuntu 12.10 安裝R

# 2013.5.6

# 本篇文章說明 Ubuntu 環境中安裝統計軟體R，全部有7個步驟 (參考 pdf 下載)。

# step 1 檢視 Ubuntu 版本

lsb_release –a

# step 2 備份sources.list

sudo cp /etc/apt/sources.list /etc/apt/sources.list.bak

# step 3 編輯sources.list

sudo gedit /etc/apt/sources.list

# 在檔案最後新增一列與以下內容
deb http://cran.csie.ntu.edu.tw/bin/linux/ubuntu quantal/
注意：隨著版本不同，最後加上 quantal 可能修改成合適版本。

# 按 File->Save 儲存檔案

# step 4 更新套件

sudo apt-get update

# step 5 安裝R

sudo apt-get install r-base

或採用包括發展工具等套件指令(建議採用以下方法加上 r-base-dev)
sudo apt-get install r-base r-base-dev

# step 6 執行R

在終端機視窗中輸入 R 即可開啟R視窗

# step 7 新增至左側啟動器

選取 啟動器最上方 Ubuntu 按鈕，輸入 r，將Ｒ圖示拖拽至左側啟動器，下次直接按R圖示即可。
 # end #

下載 ubuntu_install_R.pdf